Comment on Particle tracking plugins file formats and converter by katpyxa
In reply to Manu.
Hello Manu,
no, unfortunately I didn’t do that, sorry.
The best way to get answers on Trackmate’s XML format is to contact author, Jean Yves Tinevez (see here http://fiji.sc/User:JeanYvesTinevez) or check the source code of Trackmate, looking for “import” function here
https://github.com/fiji/TrackMate/tree/master/src/main/java/fiji/plugin/trackmate/io
Cheers,
Eugene
Comment on Particle tracking plugins file formats and converter by Manu
Hello, I am interested in importing data from MTrackJ to Trackmate and so I must convert the mdf files from MTrackJ to xml for Trackmate. You included a java script to go from xml to mdf, is there a script to due the oppisite? (go from mdf to xml)
I’m sure I can write a script to save the track info of an mdf file saved as an xml but I’m not sure what headers and source element Trackmate looks for in an xml file.
Any help would be much appreciated!
– Manu
Про геополитические нюансы
По работе отправил четыре идентичные посылки: специальные пробирки для крови, чтоб наши коллабораторы прислали обратно в них образцы крови своих подопечных. Все посылки упакованы, подписаны, и оформлены идентично, и отправлены FedEx'ом из Далласа.
Место назначения:
1. США, Чикаго - посылка получена на следующий день.
2. Канада - посылка получена через день.
3. Испания - посылка достигла Испании за два дня; позже недельку гуляла по стране; через неделю позвонили испанские федексьеры и сказали что адрес указан не точно. Я уже опытный, поэтому достал с телефона фотографию коробки со всеми адресами, и связался с адресатами. Они подтвердили, что адрес правильный. Я перезвонил обратно федексьерам, и сказал...
...Наталья никогда не мечтала стать профессиональной актрисой, так как с детства увлекалась биологией и съёмки в кино считала не более, чем детским приключением. Закончив школу в 1989 году она поступила в Московский институт тонкой химической технологии им. М. В. Ломоносова (МИТХТ) на отделение биотехнологии, который закончила в 1994 году. После этого длительное время работала научным сотрудником НИИ. В настоящее время Наталья является одним из руководителей компании, разрабатывающей и производящей иммуноферментные тест-системы для диагностики ряда инфекционных заболеваний.... (Wiki).
И история в тему: http://godfrua.livejournal.com/53221.html
comments
Полюби свои жировые клетки!
Всем известен «стандарт» женской красоты — 90–60–90. Особенно «пугающей» цифрой из этой тройки кажется 60, а именно — обхват талии. Для достижения желанных 40 кило многие девушки сидят на жёстких диетах, ограничивают себя в еде и радуются каждому ушедшему килограмму. Стоп, девушки! Остановитесь!
Недавняя работа показала — клетки, присутствующие в жировой ткани, важны для иммунитета и защищают нас от инфекций: в частности, от золотистого стафилококка.
Читайте дальше - "Полюби свои жировые клетки!"
comments
Nature #517(7533): много красивой нейробиологии, а также секс доисторических рыб
В номере журнала Nature 517(7533), вышедшем 8 января 2015 года, рассказывается о нейро-компасе летучих мышей, кишечной микрофлоре, двойной роли глутатиона и простагландина, страстях ископаемых рыб, перипетиях B- и T-лимфоцитов, восстановлении нервов у червей и тепловом эффекте ферментативных реакций.
Читать полностью - Nature #517(7533)
comments
Технический редактор на «биомолекуле»
Биомолекула.ру объявляет вакансию технического редактора.
Мы ищем технического редактора-супермена, обладающего практически не встречающимся в дикой природе набором качеств: 1. Врожденная грамотность; 2. Непревзойденное умение оформлять и вычитывать тексты; 3. Искренняя симпатия к «Биомолекуле»*, 4. Хотя бы базовые представления о современной биологии; 5. Базовые навыки работы с растровой и векторной графикой;6. Умение загружать файлы на сервер и скачивать их обратно, когда они там больше не нужны (шутка); 7. Знание html на уровне верстки текста, картинок и таблиц;8. Исполнительность и пунктуальность (не шутка).
Кто узнал в перечисленных выше пунктах себя — пришлите на наш редакционный адрес (editorial@biomolecula.ru) короткий рассказ о себе и свое резюме до 16 января 2015 года. Ждем...
Nature #517: много структурных работ и новые нюансы регулировки трансляции
В 2015 году «Биомолекула» будет иногда делать дайджесты биологических статей основных естественнонаучных журналов — Nature и Science. По ссылке первый выпуск, посвященный номеру Nature #517, вышедшему 1 января 2015 года.
В выпуске:
Молекулярная биология и биоинформатика. Обнаружен еще один, доселе неведомый, слой в многослойной регуляции трансляции. Все завязано непосредственно на рибосому: особые последовательности мРНК, напоминающие IRES, крепко цепляются за рибосому и изменяют уровень трансляции своей мРНК. Это поражающее воображение явление показано пока только для Hox-генов мышей и видимо играет роль при эмбриогенезе. — RNA regulons in Hox 5′ UTRs confer ribosome specificity to gene regulation. Структурная биология. С помощью электронной криомикроскопии детально...
Появление и эволюция клеточной мембраны
У всех современных организмов клеточная мембрана играет принципиальную роль в энергетическом обмене и других биохимических процессах. Новые исследования эволюции мембран позволяют ответить на многие каверзные вопросы: как мембрана появилась у нашего далекого предка LUCA, почему мембраны бактерий и архей так непохожи и каким образом эукариоты обзавелись мембранными органеллами.
Читать целиком - "Появление и эволюция клеточной мембраны"
comments